Jakość i wartość kolonoskopii w największym stopniu zależą od starannego oczyszczenia jelita.

Należy w porozumieniu ze swoim lekarzem rodzinnym lub specjalistą kardiologiem na 7 dni przed zabiegiem odstawić leki zmniejszające krzepliwość krwi (aspiryna, dikumarol, warfaryna, clopidogrel) i doustne preparaty żelaza. Dawka aspiryny do 100 mg dziennie jest dopuszczalna.

Przez 3 dni nie należy spożywać warzyw i owoców a także nasion (burak, dynia, fasola, groch, kapusta, marchew, papryka, pomidor, sałata, cytrusy, gruszki, jabłka, jagody, jeżyny, maliny, śliwki, truskawki, winogrona, mak, otręby, porzeczki, siemię, słonecznik itp.)

W dniu poprzedzającym badanie:

Zwykle śniadanie (kawa lub herbata, jasne pieczywo itp.). Dowolna ilość płynów ( woda, herbata, jasne soki) bez mleka i śmietanki oraz czerwonych soków.

Obiad: zupa – przecedzony bulion, lekkie pozbawione tłuszczów danie, herbata lub kawa (bez mleka, śmietanki i cukru).
Po obiedzie: zastosować jeden z wymienionych preparatów (EZICLEN, FORTRANS, MOVIPREP, CITRAFLEET) postępując zgodnie z załączoną do leku instrukcją.
Jeśli badanie wyznaczono na godziny poranne lek należy wypić w całości w dniu poprzedzającym badaie w wolnym tempie od popołudnia do wieczora.
Jeśli badanie wyznaczono na godziny popołudniowe następnego dnia, lek można podzielić i wypić 2/3 całkowitej dawki w dniu poprzednim, 1/3 dawki we wczesnych godzinach porannych w dniu badania. Po wypiciu leku w czasie 1,5-4 godzin nastąpi pełne oczyszczenie jelita.

Kolacja: dopuszczalne płyny: woda, herbata, jasny sok, jeśli to konieczne można zjeść jasny kisiel, galaretkę.

W dniu badania: można wypić niewielką ilość płynu (woda, jasny sok, herbata) najpóźniej na 3 godziny przed kolonoskopią wykonywaną w uśpieniu.

W przypadku kolonoskopii wykonywanej bez uśpienia, niewielką ilość płynów można przyjmować najpóźniej 1 godzinę przed badaniem.

Jeśli pacjent przyjmuje stale leki, należy je przyjąć popijając niewielką wodą, w przypadku insuliny należy ją przyjąć dopiero po kolonoskopii przed posiłkiem.